双方当事人自行约定由一方承担过户的全部税费，应当认为有效。原因有二：
第一，双方当事人约定由一方承担过户的全部税费，属于一方当事人对另一方当事人本应承担义务或债务的自愿承担，法律并不禁止，属于双方的真实意思表示，合法有效。
第二，双方当事人关于过户税费承担的约定，并不损害国家利益。
税收的主要作用有两个：其一是国家财政收入的来源，其二是税收的调控作用。双方约定由一方完全承担过户的税费，只是将一方本应缴纳的税收由另一方代为缴纳，并不因此造成国家税收的减少。
商品房过户税费谁承担，过户税费承担的约定有效吗？由上可知，当事人关于由一方当事人承担过户全部税费的约定，是具有法律效力的。本着私法自治、自愿平等的原则，法律允许由一方来承担商品房过户税费。