首先，要因地制宜选择原材料。用于发酵基质的材料很多，园林落叶、枯枝、秸秆、锯末、树皮、刨花等一些工农业废弃物及下脚料都可以，使用时将物料按自身的工艺要求切碎或粉碎到合适尺寸。用户可根据当地情况来选择廉价易得的材料，条件好的园林绿化公司还可以选择一种或多种材料科学组配进行发酵。接下来就是操作了：
1、配营养液。用2.5公斤尿素兑150-200公斤水制成尿素水，均匀地撒物料上,发酵物料的含水量要求控制在60-65%。此过程是给微生物配含"氮"营养液(微生物自身繁殖需要"氮"、"碳"等营养，尿素含"氮"高)。水分合适与否判断办法：手紧抓一把物料，见水印但不滴水，落地即散为宜。水少发酵慢，水多通气差，还会导致"腐败菌"工作而产生臭味，切记。
2、物料建堆。将调节好水分的物料建堆发酵堆一般要求：堆高1.2～1.5米(切记不能低于80厘米)，宽2米，堆的长度可以根据发酵料的多少自由调整，一般长度不要低于2米，单个发酵堆总体积不低于3立方。
3、撒料接种。等到尿素水浸透后，上面加盖透气性覆盖物，自然放置24小时，第二天把2公斤金宝贝微生物发酵菌剂与5公斤米糠混拌成增量菌剂(即把2公斤的发发酵剂"稀释"成7公斤的料，多点东西便于撒匀,同时也是给菌种提供营养)，均匀地撒在已堆好的物料堆中，做到边翻、边撒，此过程称为"接种"(也就是将金宝贝微生物发酵菌剂混和上述其他料撒入堆中，微生物工程技术上称"接种")。(注:米糠不是统糠，新鲜米糠的营养及通气性远优于陈旧米糠。万一无米糠,可用麸皮、玉米粉等替代)。
4、加盖翻倒。接完种后，在大堆上面再加盖透气性覆盖物，应做到遮光、避雨。在正常情况下，发酵处理开始后，经过5-10天发酵，温度可达到55-60℃以上，此时翻动一次，累计2-3次可完成发酵。
5、发酵完成 正常情况下秸秆及落叶类基质发酵时间为15天左右，锯末类基质25-30天，树皮类30-40天可发酵完成。发酵完成的物料呈黑褐色，手感柔软，易碎，凉干即可使用。