肉眼区别托帕石与碧玺，最重要的是碧玺有较强的二色性，而黄玉除粉红色者外，其他色的黄玉二色性都弱；另外，碧玺的双折射强，往往可见双影。
蓝色托帕石与海蓝宝石的区别，一般情形是较为困难的，可以作为参考的特征是：蓝色海蓝宝石往往带些黄绿色的色调并具轻微的二色性，比重较轻。确切鉴定要用折光仪等来测定。玻璃与黄玉除光泽和偏光性不同外，黄玉是天然晶体，具有良好的传热性，因而有冰冷的感觉，而玻璃则是温的。在放大条件下，黄玉有时可见到一种互不相溶的液体组成的气液包裹体，而玻璃内往往含圆球形的气泡，这点可作为辅助证据。