热带鱼生活的水温一般在20~30℃为宜。但不同种类的热带鱼对水温要求也有差异。如孔雀鱼、红剑鱼、黑玛丽等鱼种可以忍耐10℃左右的水温而不死亡，而燕鱼、虎皮鱼等水温低于18℃时就会死亡。绝大多数热带鱼对水温及其敏感，水温变化±2℃与就会得感冒，水温长期上下波动不稳定，鱼就会患各种疾病，因此，要尽量地保持水温的恒定。水温也不能过高，水温高水中的菌类会繁殖过快而影响水质。大多数鱼生活的正常温度在20~24℃为宜，繁殖水温在25~28℃为宜。控制水温常用两种方式，分为自然控制和人工控制。
冷水鱼养殖选择水源时要选择泉水和水质清新的河水，水温10～18℃为宜。以水温较高河水为水源的养殖场夏季可补充部分地下水降低水温。