苗期管理：经过催芽处理的种子，一般播种后10天左右开始发芽出土，20天左右为出苗盛期，场圃发芽率可达70％—80％。为利于种子发芽出土，经常保持种子层土壤湿润，播种前一定要灌透底水。如幼苗出土前土壤不过分干燥，最好不浇蒙头水以免降低地温和造成表层土壤板结，不利于出苗。
幼苗出土后，要设专人看雀。幼苗出齐后，立即喷洒0。5％—1％波尔多液，以后每隔7～10天喷1次，连续喷洒3—4次可预防立枯病发生。
幼苗生长期要适当控制灌水，以促进根系生长发育。苗木速生期6月中、下旬以后恰处于雨季之前的高温干旱时期，气温高而降雨量少，要及时灌溉，适当增加灌水次数，灌溉量也逐渐增多，根据土壤墒情每10—15天灌溉一次，以一次灌透为原则，采用喷灌或侧方灌水为宜。进入雨季后减少灌溉，并应注意排水防涝，做到内水不积，外水不侵入。
苗木速生期结合灌溉进行追肥，一般全年追施硫酸铵2—3次，每次亩施硫酸铵4～6千克，在苗木速生前期追第1次，间隔半个月后再追施一次。也可用腐熟的人粪尿追施。每次追肥后必须及时浇水冲洗净，以防烧伤苗木。
侧柏幼苗时期能耐一定庇荫，适当密留，在苗木过密影响生长的情况下，及时间去细弱苗、病虫害苗和双株苗，一般当幼苗高3～5厘米时进行两次间苗，定苗后每平方米床面留苗150株左右，则每亩产苗量可达15万株。
苗木生长期要及时除草松土，要做到“除早、除小、除了”。目前，多采用化学药剂除草，用35％除草醚(乳油)，每平方米用药2毫升，加水稀释后喷洒。第1次喷药在播种后或幼苗出土前，相隔25天后再喷洒第2次，连续2～3次，可基本消灭杂草。每亩用药量每次0．8千克。当表土板结影响幼苗生长时，要及时疏松表土，松土深度约1～2厘米，宜在降雨或浇水后进行，注意不要碰伤苗木根系。
侧柏苗木越冬要进行苗木防寒。在冬季寒冷多风的地区，一般于土壤封冻前灌封冻水，然后采取埋土防寒或夹设防风障防寒，也可覆草防寒。生产实践表明，埋土防寒效果最好，既简便省工，又有利于苗木安全越冬。但应注意，埋土防寒时间不宜过早，一般在土壤封冻前的立冬前后为宜；而撤防寒土又不宜过迟，多在土壤化冻后的清明前后分两次撤除；撤土后要及时灌足返青水，以防春旱风大，引起苗梢失水枯黄。
侧柏苗木多二年出圃，翌春移植。有时为了培育绿化大苗，尚需经过2—3次移植，培育成根系发达、生育健壮、冠形优美的大苗后再出圃栽植。根据各地经验，以早春3—4月移植成活率较高，一般可达95％以上。
移植密度要根据培育年限而定。苗木移植后培育1年，株行距10厘米X20厘米；培育2年，株行距20厘米X40厘米；培育3年，株行距30厘米X40厘米；培育5年生以上的大苗，株行距为1．5米X2．0米。一般培育大苗都需要经过多次移植，这样，既有利于促进苗木根系的生长发育，培育良好的冠形和干形，又可以提高土地利用率。
根据苗木的大小而采取不同的移植方法，常用的有窄缝移植、开沟移植和挖坑移植等方法。
移植后苗木管理，主要是及时灌水，每次灌透，待墒情适宜时及时采取中耕松土、除草、追肥等抚育措施。除根据园林绿化的要求进行整形修剪外，其他措施与一般针叶树种大苗培育基本相同。