鱼缸水草长黑毛的原因是水质环境等因素适合并促进了黑毛藻的生长。
黑毛藻又称刷毛藻，是草缸里比较多见的藻类之一且是草缸中最难清除的藻类之一，严重影响整个草缸的美观。
黑毛藻产生的原因大多是因为生态平衡没有建立好。黑毛藻几乎可以利用所有的可见光进行生存，毛藻的体内构造与其它藻类有很大的不同，体内含有固氨酶，可以自己将缸内的溶氨进行转化，自我吸收，黑毛藻主要是以孢子类方式进行繁殖衍生的，通常在水草缸引进其它新的生物的时候便会将这些孢子带进来。
清除黑毛藻的方法如下：
1、生物处理法：在黑毛藻前期，爆发不严重的时候可以下一些黑线飞狐、螺和大和藻虾一类可以吃黑毛藻的生物。
2、手动清除法：加强换水频率或者用杀菌灯，减少水中孢子类的数量，把已经有黑毛藻的叶子剪掉，减少扩散。
3、药物处理法：使用专门的去除黑毛藻的药剂，效果也不错。