孔雀鱼体色绚烂多彩、体型优美自然，深受人们喜爱。纯种孔雀鱼分成四大基本品系——草尾、蛇纹、马赛克、礼服，也就是我们说的“品系鱼”。根据鱼只的表现型又分为许多表现型——日本蓝、银河、美杜莎、金属、白金、圣塔玛利亚等等。
一、四大基本品系：
1、草尾：伴Y遗传，尾巴上有彼此不相连的黑色细点，越密越细者，尾背越大者，背鳍与身体连接面越大者为上品。
2、马赛克：伴Y遗传，可与许多表现型例如日本蓝、蛇纹等表现在同一鱼只上。尾巴上有很粗的黑色纹路，上品按圈分布。此品系代表鱼种有红马赛克、黄马赛克、白马赛克、蓝马赛克等。
3、礼服：伴X遗传，尾柄处发黑，那块黑色被称作“礼服斑”，是该品系的特征。
4、蛇纹：伴Y遗传，鱼只身上具有像蛇的细纹路，是该品系的特征。
二、表现型分类：
1、圣塔玛利亚：伴Y遗传，从尾柄下端连一条到眼后的线，此线以上为黑，且部分鱼只尾柄可见明显的白金鳞片。
2、白金：遗传方式不详，鱼只身上有白色的反光鳞片，似白金而得名。黄白金（马特利）、红白金（珊瑚红）、蓝白金（珊瑚蓝）、绿白金等是其变异型。
3、日本蓝：伴Y遗传，尾柄处为闪光蓝色，部分延至眼后的称为海洋蓝。
4、米卡立夫：伴X遗传，于二十世纪九十年代自斯里兰卡引入台湾，与礼服基因一起表现时在尾柄处呈现粉红的颜色，尾部是透明的粉色，此种鱼尾背较小，尤其是公鱼。
5、拉朱利：伴Y遗传，表现是在身体有整片蓝色金属光泽，既不是莫斯科蓝，也不是白金，更不是日本蓝或是珊瑚或金属，且带有这种基因的鱼通常身小尾背都非常的大。
6、银河：由白金及蛇纹经历两次基因转座使得原本只伴Y遗传的蛇纹跑到了X基因上，此种鱼的特徽是身上有大片白金鳞片以及粗得多的蛇纹，一般的银河（此指除银河双剑、银河红尾等），尾部是蛇王的纹路。
7、美杜莎：将用来改银河的蛇纹换成蕾丝就是美杜莎，尾部上下是蛇王的纹路，中间是蕾丝的纹路且常伴尾鳍中落（中部鳍面缺失或缺少）。
8、金属：伴Y遗传，是蛇纹的衍生系，表现为鱼体前半部的反光深蓝，白子时表现为粉红色或紫色。我们可以通过看这块金属的颜色判别鱼只的健康状况。健康鱼的金属块有光泽，患病的鱼或者刚到家不适应水质的鱼的金属块明显会暗淡。
三、体色分类：
1、野生色型：即是最普通、最常见的体色，也就是与野生种类的孔雀鱼相同的体色。
2、黄化型：由于鱼只黑色素合成部分受抑制，仍能合成一些黑色素，因此鱼体会表现出黄色的体色，称之为黄化，能够使鱼只的尾背颜色较明亮。