山楂树的修剪，应以冬季为主，夏季为辅：在较长的一段时期内，山楂树的管理和整形修剪都比较粗放，而且多不讲究树形，所以较为普遍地存在着树体结构紊乱、内膛光秃、表面结果、产量较低等不良现象.山楂树的整形修剪，比苹果、梨树的修剪要稍为复杂一些。在整形修剪过程中，应符合其生长结果习性和自然环境条件，如果修剪时重剪、多截，则成形晚，结果迟，早期产量不高；如缓放不剪，则树形紊乱，结果可能较早，但产量不高，后期也不丰产，既没有合理的树体结构，也没有适宜的枝组分布。山楂树的修剪原则，应是按种类和品种特性、环境条件、肥水管理水平、树势、枝势特点等灵活掌握，不能千篇一律.山楂幼树整形时，树干要低，骨干枝开张角度要大，以充分利用光热资源和空间；合理利用辅养枝，保持树势中庸健壮、树冠内良好的通风透光条件。
山楂幼树长势过旺时，形成花芽少，坐果率也低；树势旺时，花芽较多，但质量较差，坐果率低，落花落果严重；只有保持中庸树势，才能获得连年丰产。山楂树的大小年不明显，但如修剪过重，营养生长过旺，贮备营养很少，或结果数量过多，也可能出现大小年结果现象.山楂幼树的营养生长，一般比苹果树和梨树旺盛。如果修剪时强求树形，修剪量过重时，很易引起徒长，抑制花芽形成，推迟结果年限。目前，山楂树修剪中存在的主要问题是简单化。
认为只要疏除过密大枝，回缩枝组就行了。所以，有些山楂树没有树形，结构不合理，主枝过多，延长枝剪留过长，或甩放不剪，辅养枝大于骨干枝，上强下弱，基部光秃，内膛空虚，结果面积小，产量低。还有的山楂园，定植后不定干，顶芽枝延伸过长，单枝生长，总枝量不多，结果枝少，影响早期产量；有的山楂树定干后，萌发的枝条全部保留，一枝不疏，中干上枝条密集，主枝强，主干弱。这种修剪方法，虽然也可以早结果，但因整形不合理，枝组很少，产量很低，质量也差，造成树形紊乱，主侧枝不分，枝组很少，辅养枝大于骨干枝的不正常现象。
保留辅养枝，虽然可以早结果，但如辅养枝数量过多，势必影响内膛光照，造成树形紊乱，枝组稀少，产量低而不稳.有的山楂园，对中干轻剪长放，而对第1层的3个主枝，则进行重短截和夏季摘心，而且是反复摘心，结果造成中干过高过粗，一层主枝细小的不均衡现象；也有的山楂园，在夏季时第1层主、侧枝的延长枝，多次进行重度摘心，甚至1年3次。由于夏季摘心越早、越重，次数越多，对母枝的生长量和生长势抑制越严重。因为第1层主枝的生长受到抑制，中干的长势便更加强旺，加剧了中干强、第1层主枝弱的不均衡现象.幼树整形时，采用甩放长枝的办法培养结果枝组，也多有不当。
长枝甩放后，由于萌芽率低，中、短枝转化能力弱，易造成枝轴光秃，而且长枝甩放过多、过密，因通风透光不良，中、短枝自疏（死亡）和结果部位外移的现象就很严重。发育枝甩放后，虽然较易形成花芽，但因枝量多，枝势弱，贮备营养少，开花很少，坐果很少，内部还易光秃；也有的山楂园，只注意夏季修剪，忽视冬季修剪。夏季修剪越早，修剪量越大，次数越多，对树体的生长量和生长势的抑制就越严重。在生长季节对各级骨干延长枝进行多次重摘心，也会抑制骨干枝的生长，影响树冠扩大。