压缩空气式雾化器的效果明显好于超声雾化。压缩雾化使用原药雾化，不需要稀释，临床的效果也好，几乎是没有药物的残留量的，药物的利用率高。雾化的颗粒也是超细，不易碰撞结合，人体吸入舒适，而且能够进入支气管、肺部等的气管，临床的效果也是极佳的，是非常适宜下呼吸道的疾病治疗的，特别是儿童也可顺利的吸入。
超声雾化器一般是利用超声原理产生的药液气雾颗粒大，使得大部分的药液仅能沉积在口腔、喉部等上呼吸道，不能够有效地治疗下呼吸道疾病，而且儿童是无法吸入的。超声波雾化需要水来作传导能量，导致患者吸入了过多的水蒸气，使呼吸道湿化，加大呼吸道的阻力，可能会产生缺氧的现象。
超声波雾化器会使药液结成水珠然后挂在内腔壁上，造成浪费的现象，另外，压缩雾化器也具有一定的适用热群，不能满足特殊的需求，所以两款雾化器各有不同，要具体情况进行具体分析，这样才可以达到有效的治疗效果。