放掉水箱里的水，双手握住真空管来回旋转，使其松动，然后往水箱上推动，使其底部能够从底座出来，然后往下拽，这样就可以取出真空管，把真空管里的水倒掉，然后用清洁的水反复涮干净，这样依次将全部的真空管清洁干净后，往水箱里加自来水，使水箱里的水垢流出，再逐个将真空管安装好就可以了，安装时应检查水箱安装孔处的密封圈是否完好，如果有破损的情况，应更换新的密封圈。
另外，在使用过程中，应随往水箱里加水，尽量使水箱里的水温下降，最好不要超过75度，这样可减少水垢的产生。
水垢的形成是一个复杂的物理化学过程，其原因有内因和外因两个方面。一是水中有钙、镁离子及其它重金属离子存在，是水垢形成的根本原因也叫内因；二是固态物质从过饱和的水中沉淀析出并粘附在金属受热面上，是水垢形成的外因。当含有钙、镁等盐类杂质的水进入加热体后，吸收高温传给的热量，钙、镁盐类杂质便会发生化学反应，生成难溶物质析出。当达到一定浓度时，析出物就会成为固体沉淀，受热面的内壁上，形成一层“膜”，阻碍热量传递，这层“膜”称之为水垢。水垢的形成需要同时达到两个基本条件：
1、水温较长时间保持在70度以上；
2、 水相对保持静止状态。
水垢的组成或成分是比较复杂的，通常都不是一种单一化合物，而是以一种化学成分为主，并同时含有其它化学成分。按其水垢的化学成分，一般可分为碳酸盐水垢、硫酸盐水垢、硅酸盐水垢、氧化铁水垢、含油水垢、混合水垢及泥垢等几种。
水垢是一种导热性能极差的物质，会阻碍热的传递，致使热水器受热不均匀，造成局部过热的现象，或者局部压力过大，最终损坏热水器，甚至发生危险。
目前大部分电热水器都设计安装了镁棒，采用此类电热方法，该方法是一种比较成熟也比较价廉物美的电加热方法，经过通电，镁棒产生阳极离子，从而减少水垢的产生和沉积，但是镁棒只有在电热水器通电加热时才起作用，因此专家认为电热水器正确的使用方法应和冰箱一样，长期通电运转。
水垢会危害人的健康。天然水中含有各种矿物质，因此天然水存在着金属离子，国家饮用水卫生标准对此有所限制，在这些限制范围内对人体不会有害，而空气中的二氧化碳易溶于水中，从而形成碳酸钙和碳酸镁沉淀，这些沉淀在沉淀过程中会吸附水中微量的重金属离子，从而形成水垢。水垢不溶于水只是相对的，水加热后便有部分沉淀会溶解，这会把形成沉淀的重金属离子重新带入水中，使水中的重金属离子的含量超过卫生标准的要求，危害人体健康，如碳酸钙、碳酸镁在人体内大量沉积易形成结石。汞会引起胎儿畸形。